卒論
【２０２３年３月 卒業論文】 梶尾奈未 聴診音を用いた睡眠時無呼吸症候群の検知の試み 齋藤雅史 病院内で発生した新型コロナ感染症の感染経路推定 坂上雅人 機械学習の分類精度に基づいた皮質脳波の解析 溝口蓮 RAASに対する腸内細菌の影響 【２０２２年３月 卒業論文】 金廣祐輔 非翻訳RNA分類への自然言語処理技術の応用 島田彩花 歩行データによる個人特定の精度向上 張鎬俊 モーションデータを用いた馬の行動分類の精度向上 宮本慎 人工データセットを用いたカメラトラップの自動判別の精度向上に関する研究 【２０２１年３月 卒業論文】 後川侑都 動物の追従行動の解析 重弘到真 シルエット画像に対するオプティカルフロー計算の精度改善 出野佑真 オプティカルフローに基づく動物の行動分類 山田岳大 SMOTEを用いた2値特徴データの分類精度改善 佐々木結衣 検査タスクが皮質脳波に与える影響の解析 【２０２０年３月 卒業論文】 田原幹太 SiamMaskを用いた動物のリアルタイム追跡及びセグメンテーション 林隼平 動体と影の識別における影の濃さの影響に関する研究 林将平 痛みがマウスの行動に与える影響の解析 鮒岡良樹 動画像修復を用いた動物の檻部分の補間 張高鵬 人工データの拡張によるナンバープレート地域名の認識 【２０１９年３月 卒業論文】 上田貴哉 動物の歩行に基づく類似行動の分析 木戸康文 移動軌跡を用いた動物の行動分析 辰巳祐大 動物の姿勢認識結果を用いた行動認識 中川湧介 合成データの拡張によるナンバープレートの番号認識 【２０１８年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 川村晃司 深度センサー付きカメラを用いた動物の検知とサイズ測定 寺西祥 TensorFlow Object Detection APIを用いた動物の足の検出と追跡 渋川大陽 移動の軌跡を用いた動物個体の特徴分析 宇野智江 動物の行動認識のための檻の陰部分の補間 社本絵里香 R-CNN を用いたナンバープレート認識 村上薫 統計的形状モデルを用いた線虫の神経細胞の自動アノテーション技術の開発 【２０１７年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 合場雅志 カテゴリカルな特徴と数量的特徴を用いた配列分類の精度向上 川口翔太郎 スパースモデリングを用いた遺伝子変異データの特徴選択 堀口玲央 テキストマイニングを用いた金沢大学研究者の特徴解析 浅野剛史 動物の行動認識のための背景除去とボディパーツ認識 窪田亨 サポートベクトルマシンを用いたナンバープレート検出 門前智朗 撮影された物体に対する統計的形状モデルの半自動構築手法の開発 【２０１６年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 古市佑哉 可視画像と近赤外画像を結合した注射補助システムの改良 竹村直太 実寸動画におけるオブジェクトトラッキング機能の実現 田村正幸 画像の２次曲率を利用した血管内皮細胞画像に対する細胞検出ソフトウェアの開発 梶谷成也 機械学習を用いたクロストリジウム株の変異解析 嶋口芳希 薬剤の活性予測に適したディープラーニングのパラメータ探索 【２０１５年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 長谷篤志 次世代シーケンサを用いたMRSA株の変異解析 森元史翔 気象観測データの収集・配信システムの構築 濱田浩光 実寸写真表示のための仮想大画面の実現 橋本祐 深度情報を用いた実寸動画の実現 石本佑 可視画像と近赤外画像を統合した注射補助システムの実現 齊藤雄太 4Dライブセルイメージデータ内のディスタンスマップを用いた細胞核検出 【２０１４年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 山本直樹 Denoising Autoencoderを用いた配列データからの深層学習 鈴木悠太 Restricted Boltzmann Machineを用いた配列データからの深層学習 山田琢己 そらなっとうの納豆菌に関する変異解析 大井亜祐美 safe-SMOTEにおける安全領域の形状と大きさに関する研究 的場一将 実寸写真の共有に関する研究 【２０１３年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 水上直紀 機械学習を用いたアミノ酸配列からのレクチンの予測 島田賢人 RNA-seqデータからの新規リードスルー遺伝子の発見 牛尾凜太郎 全クラスのオーバーサンプリングによる分類精度向上 冨田直希 Exif情報の埋め込みによる交換可能な実寸写真の実現 渡部起平 補助基準物を用いた実寸写真の精度向上 【２０１２年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 松山哲生 Snakeを用いた肺腫瘤の輪郭抽出に関する研究 川口翔太郎 基準物を用いた画像内オブジェクトの計測に関する研究 武田徳明 構文情報を用いた名詞の意味推定に関する研究 栗山久範 k-mer頻度による配列の特徴付けと次元圧縮の効果に関する研究 架谷祐希 距離に基づく近傍法に関する研究 【２０１１年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 門端卓朗 生物種推定における不整合性の検出と精度改善に関する研究 谷直征 相関行列に基づいたがんマイクロアレイデータセットの比較解析 関谷修吾 タイムコースデータからの遺伝子発現量予測の精度向上に関する研究 島津純哉 多変量解析による多機能遺伝子の推定 澤田紘樹 遺伝子発現データ特異的GO termの新規同定法の有用性検討 【２０１０年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 中野賢司 検索エンジンのn-gram統計データを用いた単語の意味分類に関する研究 中山剣太 配列断片の構造エントロピーを用いたタンパク質立体構造分類に関する研究 酒井英行 相関行列に基づいたマイクロアレイデータセットの比較に関する研究 宮原大貴 細胞種間におけるDNAメチル化の比較 河野曜介 DNAメチル化のデータベース作成 【２００９年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 吉田正和 評価分析手法を用いた薬剤の効果分析に関する研究 前田康孝 複数の形容詞と名詞の修飾関係に基づく単語の意味分類に関する研究 辰巳和也 ファジィクラスタリングを用いた単語の多義性の解析に関する研究 寺田圭祐 述語項構造に基づく動詞の意味分類に関する研究 神谷道夫 遺伝子制御ネットワークに影響を及ぼすDNAメチル化の同定 【２００８年３月 卒業論文（動画は学内限定）】 明姓愛香 形容詞-名詞の修飾関係に基づく単語の意味分類に関する研究 太田和徳 計算機シミュレーションによる蛋白質間相互作用の予測
修論
【２０２３年３月 修士論文】 佐々木結衣 皮質脳波における電極間の関係解析および可視化手法の提案 重弘到真 データ拡張および損失関数の変更がFew-shot segmentationの精度に与える影響 【２０２２年３月 修士論文】 鮒岡良樹 群れにおける小型魚類の行動解析 林隼平 姿勢認識に基づく教師無し行動抽出の高精度化 【２０２１年３月 修士論文】 上田貴哉 Spatiotemporal Imageを用いた動物行動分類の精度評価 辰巳祐大 姿勢認識に基づく複合的行動および繰り返し行動の解析 【２０２０年３月 修士論文】 宇野智江 Semantic Segmentationにおける合成背景を用いた学習 【２０１９年３月 修士論文】 合場雅志 配列分類への単語埋め込みの応用 浅野剛史 Dynamic Imageを用いた動物行動の分類 穴田航太 深層学習を用いた様々な動物の姿勢認識 川口翔太郎 深層学習を用いた脳波の分類 【２０１８年３月 修士論文（動画は学内限定）】 嶋口芳希 核内移行タンパク質の局在部位予測 古市佑哉 深度センサ付きカメラを用いた動体検出と背景除去 三宅凌馬 臨床脳波検査のための自動アノテーションシステムの構築 田村正幸 状態空間モデルと整数計画法を基盤とした細胞画像領域検出および細胞追跡の同時最適化 【２０１７年３月 修士論文（動画は学内限定）】 齊藤雄太 線虫の神経細胞配置データを利用した神経細胞名特定のための人工知能技術の開発 長谷篤志 ホウキタケ属のゲノム配列解析 濱田浩光 深度センサ付きカメラを用いた動物体表面のトラッキング 森元史翔 二次元降雪粒子データの凹凸形状解析 【２０１６年３月 修士論文（動画は学内限定）】 Nguyen, Ngoc Giang DNA Sequence Classification by a Deep Learning Algorithm for Text Classification 山本直樹 テキストマイニングを用いた薬剤と病気の関係抽出 鈴木悠太 細胞移動経路の最適化に基づく4D画像データ中の細胞領域自動追跡手法の開発 【２０１５年３月 修士論文（動画は学内限定）】 島田賢人 遺伝子発現データ視覚化のための次元削減手法統合ソフトウェアの開発 【２０１４年３月 修士論文（動画は学内限定）】 川口翔太郎 ライブセル4Dイメージ内の多数の細胞領域を対象としたマルコフ確率場に基づく追跡手法の開発 武田徳明 テキストマイニングを用いた抗がん剤関連の知識抽出 【２０１３年３月 修士論文（動画は学内限定）】 谷直征 状態空間モデルを用いた超高次元逐次データに対するクラスタリング手法の開発 門端卓朗 メタゲノムアセンブラMetaVelvetの有効性の検証 【２０１２年３月 修士論文（動画は学内限定）】 張鵬 Classification of Kinase Group in Protein Phosphorylation based on 3D Structure of Substrates（ タンパク質リン酸化修飾における基質構造情報に基づくキナーゼ分類に関する研究） Tran Vu Anh D-IMPACT: A Data Preprocessing Method to Optimize the Intracluster and Intercluster Similarity for Clustering（クラスタリングのためのクラス内およびクラス間類似度を最適化するデータ処理手法Ｄ-ＩＭＰＡＣＴに関する研究） 中山剣太 局所的なクラスインバランスに着目したオーバーサンプリング手法に関する研究 【２０１１年３月 修士論文（動画は学内限定）】 吉田正和 ヒストンのメチル化制御酵素が標的とする遺伝子の探索とがんの抑制との関連に関する研究 前田康孝 構文情報を用いたセンテンス間の意味的類似性の計算方法に関する研究 辰巳和也 クラスタリングを用いた局所適応型オーバーサンプリングとその効果に関する研究 神谷道夫 細胞種間遺伝子ネットワーク差異に寄与するエピゲノムの同定 【２０１０年３月 修士論文（動画は学内限定）】 明姓愛香 生物医学用語の意味推定に関する研究 嶋田孝徳 遺伝子発現データの階層的分類 瀬戸司 エピトープ領域の抗原性に対する分子動力学的アプローチ 太田和徳 蛋白質間結合に影響を及ぼす遺伝子多型の探索 守優輔 行動解析による魚類網膜ドパミン細胞の機能解析
研究会・全国大会・国際会議ポスター等
Delimayanti,M.K., Purnama,B., Nguyen,N.G., Mahmudah,K.R., Kubo,M., Kakikawa,M., Yamada,Y., Satou,K. Clustering and Classification of Breathing Activities by Depth Image from Kinect BIOINFORMATICS 2019: 10th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 22-24 February 2019 Purnama,B., Delimayanti,M.K., Nguyen,N.G., Mahmudah,K.R., Kubo,M., Kakikawa,M., Yamada,Y., Satou,K. On The Problem About Optical Flow Prediction for Silhouette Image BIOINFORMATICS 2019: 10th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms 22-24 February 2019 嶋口芳希, 久保守, 佐藤賢二 薬剤の活性予測に適したディープラーニングのパラメータ探索 平成28年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2. パターン認識・理解2 F2-43 2016年9月13-14日 長谷篤志, 久保守, 岩田恭宜, 和田隆志, 佐藤賢二 MRSA株の変異情報に基づく発症予測と薬剤耐性予測 平成27年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2. その他1 F2-5 2015年9月12-13日 森元史翔, 久保 守, 佐藤 賢二 気象観測データのサーバ構築 平成27年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2. その他1 F2-6 2015年9月12-13日 山本 直樹, 武田 徳明, 佐藤 賢二 テキストマイニングを用いた抗がん剤類似物質の探索 平成26年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2. その他3 F81 2014年9月11-12日 鈴木 悠太, 佐藤 賢二 Restricted Boltzmann Machineを用いた配列データからの深層学習 平成26年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2. その他3 F75 2014年9月11-12日 島田賢人, 佐藤賢二, 広瀬修 RNA-seqデータからの新規リードスルー発見 平成25年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2. 情報処理2 F2-43 2013年9月21-22日 Saethang,T., Hirose,O., Kimkong,I., Satou,K. ANALYSIS OF ANTIBACTERIAL AND TUMOR HOMING PEPTIDES USING SUPPORT VECTOR MACHINE The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013) p.64 3-10 January 2013 Dang,X.T., Hirose,O., Satou,K. IMPROVING CLASSIFICATION PERFORMANCE OF REAL AND PSEUDO MIRNA PRECURSORS The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013) p.117 3-10 January 2013 Tran,V.A., Hirose,O., Satou,K. D-IMPACT: AN EFFECTIVE METHOD TO IMPROVE THE CLUSTERING PERFORMANCE ON GENE EXPRESSION DATA The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013) p.123 3-10 January 2013 Nguyen,L.A.T., Hirose,O., Satou,K. APPLICATION OF AN UNDER-SAMPLING METHOD TO BETATURN PREDICTION The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013) p.121 3-10 January 2013 Le,T.K.T., Hirose,O., Satou,K. AN APPROACH TO EXTEND DOMAIN-DOMAIN INTERACTION NETWORKS BASED ON PROTEIN DOMAIN FUNCTIONAL SIMILARITY The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013) p.120 3-10 January 2013 Satou, K. ANALYSIS OF NOUN PHRASES EXTRACTED FROM BIOMEDICAL TEXTS FOR SEMANTIC CATEGORY PREDICTION The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013) p.122 3-10 January 2013 Satou, K., Zhang, P., Kawaguchi, S. Classification of Kinase Group in Protein Phosphorylation Joint Conference on Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology B62_136 14-17 October 2012 佐藤賢二 スマートフォン等を用いた実寸写真の生成とサイズ測定 イノベーション・ジャパン2012 I-16 2012年9月27-28日 武田徳明, 佐藤賢二 構文情報を用いた名詞の意味推定 平成24年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2.情報処理・その他 F-118 2012年9月1-2日 タンパク質リン酸化部位に作用するキナーゼの予測 川口翔太郎, 張鵬, 佐藤賢二 平成24年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2.情報処理・その他 F-119 2012年9月1-2日 Dang,X.T., Satou,K. A Novel Over-Sampling Method and its Application to Cancer Classification from Gene Expression Data The 2011 Joint Conference of CBI and JSBi CBI-P3-4 8-10 November 2011 Saethang,T., Kimkong,I., Satou,K. Quantitative HLA-Peptide Binding Prediction Using Amino Acid Pairwise Contact Potentials and HLA-Peptide Contact Site Information The 2011 Joint Conference of CBI and JSBi CBI-P3-5 8-10 November 2011 Tran,V.A., Satou,K. Predicting the Clam Yield in Ben Tre from Environmental Data The 2011 Joint Conference of CBI and JSBi CBI-P3-6 8-10 November 2011 谷直征, 関谷修吾, 佐藤賢二 サポートベクターマシンを用いた遺伝子発現量予測 平成23年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2. ヒューマンインタフェース2 F-110 2011年9月17-18日 門端卓朗, 佐藤賢二 生物種推定における不整合性の検出と精度改善に関する研究 平成23年度電気関係学会北陸支部連合大会 F2. ヒューマンインタフェース2 F-111 2011年9月17-18日 Tran,V.A., Satou,K. APPLICATION OF ATTRACTION BASED CLUSTERING ALGORITHM TO CANCER GENE DATASETS The Ninth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2011) APBC2011 Conference P262 11-14 January 2011 Zhan,P., Satou,K. PERFORMANCE EVALUATION OF SUPPORT VECTOR MACHINES FOR POST-TRANSLATIONAL MODIFICATION The Ninth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2011) APBC2011 Conference P278 11-14 January 2011 Satou,K. SEMANTIC CLUSTERING OF BIOMEDICAL WORDS USING GOOGLE WEB 1T 5-GRAM The Ninth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2011) APBC2011 Conference P285 11-14 January 2011 宮原大貴 佐藤賢二 山田洋一 ヒトのCpG islandにおけるDNAメチル化状態の検討 平成22年度電気関係学会北陸支部連合大会 B部門 回路・医用電子 B-12 2010年9月11-12日 中山剣太 辰巳和也 山田洋一 佐藤賢二 rRNA配列を用いた真核生物の生物種推定におけるSMOTEの効果について 平成22年度電気関係学会北陸支部連合大会 F部門 情報処理 情報処理3 F-54 2010年9月11-12日 Kamiya,M., Satou,K., Yamada,Y. Identification of DNA Methylation Which Leads to Differences of Gene Interaction Network between Cell Types The 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009) Genome Informatics 2009 (Poster and Software Demonstrations) P037-1,P037-2 14-16 December 2009 Myosho,A., Nakano,K., Yamada,Y., Satou,K. Semantic Classification of Nouns in UMLS Using Google Web 1T 5-gram The 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009) Genome Informatics 2009 (Poster and Software Demonstrations) P102-1,P102-2 14-16 December 2009 嶋田孝徳, 山田洋一, 佐藤賢二 遺伝子発現データの階層的分類に関する研究 平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会 F部門 情報処理 情報処理2 F-64 2009年9月12-13日 辰巳和也, 山田洋一, 佐藤賢二 配列からの酵素機能推定手法の改善について 平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会 F部門 情報処理 情報処理2 F-65 2009年9月12-13日 吉田正和, 山田洋一, 佐藤賢二 rRNA配列を用いた真核生物の生物種推定手法 平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会 F部門 情報処理 情報処理2 F-66 2009年9月12-13日 瀬戸司, 山田洋一, 佐藤賢二 エピトープ領域の部分配列の抗原性と立体構造の関係について 平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会 F部門 情報処理 情報処理2 F-67 2009年9月12-13日 中野賢司, 山田洋一, 佐藤賢二 検索エンジンのn-gram統計データを用いた単語の意味分類 平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会 F部門 情報処理 パターン認識・理解3 F-47 2009年9月12-13日 前田康隆, 山田洋一, 佐藤賢二 複数の形容詞と名詞の修飾関係に基づく単語の意味分類に関する研究 平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会 F部門 情報処理 知識処理/ニューラルネットワーク F-49 2009年9月12-13日 明姓愛香, 山田洋一, 佐藤賢二 単語の意味分類における潜在意味解析の効果について 平成20年度電気関係学会北陸支部連合大会 F部門 情報処理関係 知識処理 F-42 2008年9月12-13日 太田和徳, 山田洋一, 佐藤賢二 蛋白質機能に影響を及ぼす遺伝子多型の探索 平成20年度電気関係学会北陸支部連合大会 B部門 回路・医用電子関係 回路・医用電子３ B-13 2008年9月12-13日 Myosho,A., Miyata,Y., Yamada,Y., Satou,K. Analysis of Adjective-Noun Co-occurrence In Biomedical Text The Sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2008) The Sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (Poster Abstract) P91 14-17 January 2008
ジャーナル・国際会議
Urushihara,R., Takezako,N., Yoroidaka,T., Yamashita,T., Murata,R., Satou,K., Nakao,S., Takamatsu,H. Eight-color multiparameter flow cytometry (EuroFlow-NGF) is as sensitive as next-generation sequencing in detecting minimal/measurable residual disease in autografts of patients with multiple myeloma eJHaem, Vol.4, pp.184-191 2023.1 Takemori-Sakai,Y., Satou,K., Senda,Y., Nakamura,Y., Otani,H., Maekawa,A., Oe,H., Oshima,M., Yoneda-Nakagawa,S., Miyagawa,T., Sato,K., Ogura,H., Mori,M., Wada,T., Sakai,Y., Yutani,M., Matsumura,T., Fujinaga,Y., Gabata,T., Wada,T., Iwata,Y. Rare toxin A-negative and toxin B-positive strain of Clostridioides difficile from Japan lacking a complete tcdA gene Journal of Infection and Chemotherapy, Vol.28, Issue 5, pp.651-656 2022.5 Indriani,F., Mahmudah,K.R., Purnama,B., Satou,K. ProtTrans-Glutar: Incorporating Features From Pre-trained Transformer-Based Models for Predicting Glutarylation Sites Frontiers in Genetics, 13:885929 2022.5 Mahmudah,K.R., Indriani,F., Takemori-Sakai,Y., Iwata,Y., Wada,T., Satou,K. Classification of Imbalanced Data Represented as Binary Features Applied Sciences, Vol.11, No.17, 7825 2021.8 Purnama,B., Delimayanti,M.K., Mahmudah,K.R., Indriani,F., Kubo,M., Satou,K. The Enrichment of Texture Information to Improve Optical Flow for Silhouette Image International Journal of Advanced Computer Science and Applications, Vol.12, No.2, pp.423-428 2021.3 Onouchi,H., Motomura,T., Idesako,N., Takahashi,A., Murase,M., Fukuyoshi,S., Endo,T., Satou,K., Naito,S., Itoh,M. Exhaustive identification of conserved upstream open reading frames with potential translational regulatory functions from animal genomes Scientific Reports, 10:16289 2020.10 Takahashi,H., Hayashi,N., Hiragori,Y., Sasaki,S., Motomura,T., Yamashita,Y., Naito,S., Takahashi,A., Fuse,K., Satou,K., Endo,T., Kojima,S., Onouchi,H. Comprehensive genome-wide identification of angiosperm upstream ORFs with peptide sequences conserved in various taxonomic ranges using a novel pipeline, ESUCA BMC Genomics, 21:260 2020.3 Delimayanti,M.K., Purnama,B., Nguyen,N.G., Faisal,M.R., Mahmudah,K.R., Indriani,F., Kubo,M., Satou,K. Classification of Brainwaves for Sleep Stages by High-Dimensional FFT Features from EEG Signals Applied Sciences, Vol.10, No.5, 1797 2020.3 Iwata,Y., Satou,K., Furuich,K., Yoneda,I., Matsumura,T., Yutani,M., Fujinaga,Y., Hase,A., Morita,H., Ohta,T., Senda,Y., Sakai-Takemori,Y., Wada,T., Fujita,S., Miyake,T., Yasuda,H., Sakai,N., Kitajima,S., Toyama,T., Shinozaki,Y., Sagara,A., Miyagawa,T., Hara,A., Shimizu,M., Kamikawa,Y., Ikeo,K., Shichino,S., Ueha,S., Nakajima,T., Matsushima,K., Kaneko,S., Wada,T. Collagen adhesion gene is associated with bloodstream infections caused by methicillin-resistant Staphylococcus aureus International Journal of Infectious Diseases, Vol.91, pp.22-31 2020.2 Kanamasa,S., Minami,T., Okabe,M., Park,E.Y., Fujimoto,T., Takahashi,A., Murase,M., Fukuyoshi,S., Oda,A., Satou,K., Takahashi,H. Draft Genome Sequence of Aspergillus terreus High-Itaconic-Acid-Productivity Mutant TN-484 Microbiology Resource Announcements, 8(49), e01170-19 2019.12 Kanamasa,S., Yamaguchi,D., Machida,C., Fujimoto,T., Takahashi,A., Murase,M., Fukuyoshi,S., Oda,A., Satou,K., Takahashi,H. Draft Genome Sequence of Saccharomyces cerevisiae Strain Pf-1, Isolated from Prunus mume Microbiology Resource Announcements, 8(46), e01169-19 2019.11 Nguyen,N.G., Delimayanti,M.K., Purnama,B., Mahmudah,K.R., Kubo,M., Kakikawa,M., Yamada,Y., Satou,K. Applying Deep Learning Models to Action Recognition of Swimming Mice with the Scarcity of Training Data the 12th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies (BIOSTEC 2019), pp.270-275 22-24 February 2019 Satou,K., Shimaguchi,Y., Mahmudah,K.R., Nguyen,N.G., Delimayanti,M.K., Purnama,B., Kubo,M., Kakikawa,M., Yamada,Y. Prediction of Subnuclear Location for Nuclear Protein the 12th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies (BIOSTEC 2019), pp.276-280 22-24 February 2019 Nguyen,N.G., Phan,D., Lumbanraja,F.R., Faisal,M.R., Abapihi,B., Purnama,B., Delimayanti,M.K., Mahmudah,K.R., Kubo,M., Satou,K. Applying Deep Learning Models to Mouse Behavior Recognition Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.12 No.2, pp.183-196 2019.2 Takahashi,H., Sakagawa,E., Sakakibara,I., Machida,C., Miyaki,S., Takahashi,A., Onai,S., Fukuyoshi,S., Ohta,A., Satou,K., Kanamasa,S. Draft Genome Sequence of Saccharomyces cerevisiae Strain Hm-1, Isolated from Cotton Rosemallow Microbiology Resource Announcements, Vol.7, Issue.13, e01184-18 2018.10 Faisal,M.R., Abapihi,B., Nguyen,N.G., Purnama,B., Delimayanti,M.K., Phan,D., Lumbanraja,F.R., Kubo,M., Satou,K. Improving Protein Sequence Classification Performance Using Adjacent and Overlapped Segments on Existing Protein Descriptors Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.11 No.6, pp.126-143 2018.6 Lumbanraja,F.R., Nguyen,N.G., Phan,D., Faisal,M.R., Abapihi,B., Purnama,B., Delimayanti,M.K., Kubo,M., Satou,K. Improved Protein Phosphorylation Site Prediction by a New Combination of Feature Set and Feature Selection Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.11 No.6, pp.144-157 2018.6 Phan,D., Nguyen,N.G., Lumbanraja,F.R., Faisal,M.R., Abapihi,B., Purnama,B., Delimayanti,M.K., Kubo,M., Satou,K. Combined Use of k-Mer Numerical Features and Position-Specific Categorical Features in Fixed-Length DNA Sequence Classification Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.10, No.8, pp.390-401 2017.8 Nguyen,N.G., Tran,V.A., Ngo,D.L., Phan,D., Lumbanraja,F.R., Faisal,M.R., Abapihi,B., Kubo,M., Satou,K. DNA Sequence Classification by Convolutional Neural Network Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.9, No.5, pp.280-286 2016.4 Ngo,D.L., Yamamoto, N., Tran,V.A., Nguyen,N.G., Phan,D., Lumbanraja,F.R., Kubo,M., Satou,K. Application of Word Embedding to Drug Repositioning Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.9, No.1, pp.7-16 2016.1 Miyahara,H., Hirose,O., Satou,K., Yamada,Y. Factors to preserve CpG-rich sequences in methylated CpG islands BMC Genomics, 16:144 2015.2 Gavrilov,S., Kubo,M., Tran,V.A., Ngo,D.L, Nguyen,N.G., Nguyen,L.A.T., Lumbanraja,F.R., Phan,D., Saethang,T., Satou,K. Feature Analysis and Classification of Particle Data from Two-Dimensional Video Disdrometer Advances in Remote Sensing, Vol.4, No.1, pp.1-14 2015.1 Nguyen,L.A.T., Dang,X.T., Le,T.K.T., Saethang,T., Tran,V.A., Ngo,D.L, Gavrilov,S., Nguyen,N.G., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. Predicting Beta-Turns and Beta-Turn Types Using a Novel Over-Sampling Approach Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.7, No.11, pp.927-940 2014.9 Li,J., Liu,J., Toivonen,H., Satou,K., Sun,Y., Sun,B. Discovering Statistically Non-Redundant Subgroups Knowledge-Based Systems, Vol.67, pp.315–327 2014.9 Le,T.K.T., Hirose,O., Nguyen,L.A.T., Saethang,T., Tran,V.A., Dang,X.T., Ngo,D.L, Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. Inference of domain-domain interactions by matrix factorisation and domain-level features International Journal of Functional Informatics and Personalised Medicine, Vol.4, Issue 3-4, pp.259-273 2014 Tran,V.A., Hirose,O., Saethang,T., Nguyen,L.A.T., Dang,X.T., Le,T.K.T., Ngo,D.L, Gavrilov, S., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. D-IMPACT: A Data Preprocessing Algorithm to Improve the Performance of Clustering Journal of Software Engineering and Applications, Vol.7, No.8, pp.639-654 2014.7 Le,T.K.T., Hirose,O., Tran,V.A., Saethang,T., Nguyen,L.A.T., Dang,X.T., Ngo,D.L, Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. Predicting residue contacts for protein-protein interactions by integration of multiple information Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.7, No.1, pp.28-37 2014.1 Nguyen,L.A.T., Hirose,O., Dang,X.T., Le,T.K.T., Saethang,T., Tran,V.A., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. Improving the Prediction of Protein-Protein Interaction Sites Using a Novel Over-Sampling Approach and Predicted Shape Strings Annual Review & Research in Biology, Vol.3, Issue 2, pp.92-106 2013.3 Le,T.D., Liu,L., Liu,B., Tsykin,A., Goodall,G.J., Satou,K., Li,J. Inferring microRNA and transcription factor regulatory networks in heterogeneous data BMC Bioinformatics 2013, 14:92 2013.3 Dang,X.T., Hirose,O., Saethang,T., Tran,V.A., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. A novel over-sampling method and its application to miRNA prediction Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.6, No.2A, pp.236-248 2013.2 Dang,X.T., Hirose,O., Bui,D.H., Saethang,T., Tran,V.A., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. A Novel Over-Sampling Method and its Application to Cancer Classification from Gene Expression Data Chem-Bio Informatics Journal, Vol.13, pp.19-29 2013.1 Saethang,T., Hirose,O., Kimkong,I., Tran,V.A., Dang,X.T., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. PAAQD: Predicting immunogenicity of MHC class I binding peptides using amino acid pairwise contact potentials and quantum topological molecular similarity descriptors Journal of Immunological Methods, Vol.387, Issues 1-2, pp.293-302 2013.1 Yamada,Y., Sawada,H., Hirotani,K., Oshima,M., Satou,K. Validation of MIMGO: a method to identify differentially expressed GO terms in a microarray dataset BMC Research Notes 2012, 5:680 2012.12 Saethang,T., Hirose,O., Kimkong,I., Tran,V.A., Dang,X.T., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. EpicCapo: epitope prediction using combined information of amino acid pairwise contact potentials and HLA-peptide contact site information BMC Bioinformatics 2012, 13:313 2012.11 Tran,V.A., Clemente,J.C., Nguyen,D.T., Li,J., Dang,X.T., Le,T.K.T., Nguyen,L.A.T., Saethang,T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. IMPACT: A Novel Clustering Algorithm based on Attraction Journal of Computers, Vol.7, No.3, pp.653-665 2012.3 Kong,D., Piao,Y.S., Yamashita,S., Oshima,H., Oguma,K., Fushida,S., Fujimura,T., Minamoto,T., Seno,H., Yamada,Y., Satou,K., Ushijima,T., Ishikawa,T., Oshima,M. Inflammation-induced repression of tumor suppressor miR-7 in gastric tumor cells Oncogene, Vol.31, Issue 35, pp.3949–3960 2011.12 Yoshida,M., Ishimura,A., Terashima,M., Enkhbaatar,Z., Nozaki,N., Satou,K., Suzuki,T. PLU1 histone demethylase decreases the expression of KAT5 and enhances the invasive activity of the cells Biochemical Journal, Vol.437, No.3, pp.555-564 2011.8 Tran,D.H., Ho,T.B., Pham,T.H., Satou,K. MicroRNA expression profiles for classification and analysis of tumor samples IEICE Transactions on Information and Systems, E94-D, No.3, pp.416-422 2011.3 Tran,D.H., Satou,K., Ho,T.B., Pham,T.H. Computational Discovery of miR-TF Regulatory Modules in Human Genome Bioinformation, Vol.4, No.8, pp.371-377 2010.2 Yamada,Y., Hirotani,K., Satou,K., Muramoto,K. An identification method of data-specific GO terms from a microarray data set IEICE Transactions on Information and Systems, E92-D, No.5, pp.1093-1102 2009.5 Tran,D.H., Pham,T.H., Satou,K., Ho,T.B. Finding microRNA regulatory modules in human genome using rule induction BMC Bioinformatics, Vol.9(Suppl.12):S5(10 pages) 2008.12 Tran,D.H., Pham,T.H., Satou,K., Ho,T.B. Prediction of human microRNA hairpins using only positive sample learning Journal of Biomedical Science and Engineering (JBiSE), Vol.1, Issue 2, pp.141-146 2008.8 Satou,K., Konno,K., Ohta,O., Mikami,K., Teranishi,K., Yamada,Y., Ohki,S. Performance Evaluation of Parallel Processing Environment for Molecular Dynamics WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 7, pp.173-182 2008.7 Rebolledo-Mendez,J.D., Higashihara,M., Yamada,Y., Satou,K. Characterization and Clustering of GO Terms by Feature Importance Vectors Obtained from Microarray Data WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 7, pp.163-172 2008.7 Yamada,Y., Satou,K. Prediction of Genomic Methylation Status on CpG Islands Using DNA Sequence Features WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 7, pp.153-162 2008.7 Higashihara,M., Rebolledo-Mendez,J.D., Yamada,Y., Satou,K. Application of a Feature Selection Method to Nucleosome Data: Accuracy Improvement and Comparison with Other Methods WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 5, pp.95-104 2008.5 Yamada,Y., Miyata,Y., Higashihara,M., Satou,K. Comparison of Cluster Identification Methods for Selection of GO Terms related to Gene Clusters WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 3, pp.54-63 2008.3 Clemente,J.C., Satou,K., Valiente,G. Phylogenetic reconstruction from non-genomic data Bioinformatics, Vol.23, No.2, pp.110-115 2007.1 Clemente,J.C., Satou,K., Valiente,G. Finding conserved and non-conserved reactions using a metabolic pathway alignment algorithm Genome Informatics Series, Vol.17, No.1, pp.46-56 2006.12 Satou,K., Tsuji,S., Nakashima,Y.,Konagaya,A. Parallel and pipelined database transfer in a grid environment for bioinformatics Grid Computing in Life Science, Vol.2, pp.255-262 2006.10 Yokota,K., Satou,K., Ohki,S. Comparative analysis of protein thermostability: difference in contents and substitutions of amino acid types on the surface and in the core regions of thermophilic and mesophilic proteins Science and Technology of Advanced Materials, Vol.7, pp.255-262 2006.6 Pham,T.H., Tran,D.H., Ho,T.B., Satou,K., Valiente,G. Qualitatively predicting acetylation and methylation areas in DNA sequences Genome Informatics Series, Vol.16, No.2, pp.3-11 2005.12 Clemente,J.C., Satou,K., Valiente,G. Reconstruction of Phylogenetic relationships from metabolic pathways based on the enzyme hierarchy and the gene ontology Genome Informatics Series, Vol.16, No.2, pp.45-55 2005.12 Pham,T.H., Clemente,J.C., Satou,K., Ho,T.B. Computational discovery of transcriptional regulatory rules Bioinformatics, Vol.21, Suppl.2, pp.101-107 2005.9 Pham,T.H., Satou,K., Ho,T.B. Support vector machines for prediction and analysis of beta and gamma-turns in proteins Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Vol.3, No.2, pp.343-358 2005.4 Satou,K., Yamamoto,K. Utilizing weakly controlled vocabulary for sentence segmentation in biomedical literature In Silico Biology, Vol.5, No. 1, pp.67-79 2005.3 Uchida,S., Nishida,Y., Satou,K., Muta,S., Tashiro,K., Kuhara,S. Detection and normalization of biases present in spotted cDNA microarray data: A composite method addressing dye, intensity-dependent, spatially-dependent, and print-order biases DNA Research, Vol.12, No.1, pp.1-7 2005.2 Pham,T.H., Satou,K., Ho,T.B. Mining yeast transcriptional regulatory modules from factor DNA-binding sites and gene expression data Genome Informatics Series, Vol.15, pp.287-295 2004.12 Satou,K., Nakashima,Y.,Tsuji,S., Defago,X., Konagaya,A. An integrated system for distributed bioinformatics environment on grids Grid Computing in Life Science, Vol.1, pp.5-13 2004.5 Konagaya,A., Konishi,F., Hatakeyama,M., Satou,K. The superstructure toward open bioinformatics grid New Generation Computing, Vol.22, No.2, pp.167-176 2004.2 Pham,T.H., Satou,K., Ho,T.B. Prediction and analysis of β-turns in proteins by support vector machine Genome Informatics Series, Vol.14, pp.196-205 2003.12 Oyama,T., Kitano,K., Satou,K., Ito,T. Extraction of knowledge on protein-protein interaction by association rule discovery Bioinformatics, Vol.18, No.5, pp.705-714 2002.5 Satou,K., Fuseda,Y., Konagaya,A., Takagi,T. A framework for quick-and-pinpoint data mining and its application to heterogeneous genome databases Knowledge-Based Intelligent Information Engineering Systems & Allied Technologies, Vol.5, pp.773-777 2001.9 Tsukamoto,Y., Takiguchi,K., Satou,K., Furuichi,E., Takagi,T., Kuhara,S. Application of a deductive database system to search for topological and similar three-dimensional structures in protein Computer Applications in the Biosciences, Vol.13, No.2, pp.183-190 1997.4 Satou,K., Shibayama,G., Ono,T., Yamamura,Y., Furuichi,E., Kuhara,S., Takagi,T. Finding association rules on heterogeneous genome data Biocomputing, Vol.2, pp.397-408 1997.1 Satou,K., Furuichi,E., Hashimoto,S., Tsukamoto,Y., Kuhara,S., Takagi,T., Ushijima,K. Development of a deductive database system for computing closures of similarity relationships among protein structures Journal of Japanese Society for Artificial Intelligence, Vol.11, No.3, pp.440-450 1996.5 Nishikawa,A., Satou,K., Furuichi,E., Kuhara,S., Ushijima,K. Data classification component in a deductive database system and its application to protein structural analysis IEICE (The Institute of Electronics, Information and Communication Engineers) Transactions on Information and Systems, Vol.E78-D, No.11, pp.1377-1387 1995.11 Satou,K., Furuichi,E., Kuhara,S., Takagi,T. Searches for topologically and three dimensionally similar structures in proteins Genome Informatics Series, Vol.4, pp.25-35 1993.12 Satou,K., Furuichi,E., Takiguchi,K., Takagi,T., Kuhara,S. A deductive database system PACADE for analyzing 3-D and secondary structures of protein Computer Applications in the Biosciences, Vol.9, No.3, pp.259-265 1993.3 Saethang,T., Hirose,O., Kimkong,I., Tran,V.A., Dang,X.T., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K. PAAQD: predicting immunogenicity of MHC class I binding peptides using amino acid pairwise contact potentials and quantum topological molecular similarity descriptors 11th International Conference on Bioinformatics (InCoB2012) 2012.10 Tran,D.H., Ho,T.B., Satou,K., Pham,T.H. A computational method for classifying and analyzing tumor samples using microRNA expression profiles 3rd International Conference on Knowledge, Information and Creativity Support Systems (KICSS 2008), pp.120-127 2008.12 Nguyen,T.P., Satou,K., Ho,T.B., Takabayashi,K. Constructing Signal Transduction Networks Using Multiple Signaling Feature Data Proc. of Statistical and Relational Learning in Bioinformatics (StReBio), pp.1-8 2008.9 Rebolledo-Mendez,J.D., Higashihara,M., Yamada,Y., Satou,K. Finding Hidden Relationship among Biological Concepts in Gene Ontology Proc. of the WSEAS International Conference on BIOMEDICAL ELECTRONICS and BIOMEDICAL INFORMATICS (BEBI'08), pp.237-241 2008.8 Satou,K., Konno,K., Ohta,O., Mikami,K., Teranishi,K., Yamada,Y., Ohki,S. Effect of Parallel Processing and Optimization Techniques in Molecular Dynamics Proc. of the WSEAS International Conference on BIOMEDICAL ELECTRONICS and BIOMEDICAL INFORMATICS (BEBI'08), pp.228-233 2008.8 Yamada,Y., Satou,K. Prediction of methylation status on DNA sequences and identification of its important DNA sequence features Proc. of the WSEAS International Conference on BIOMEDICAL ELECTRONICS and BIOMEDICAL INFORMATICS (BEBI'08), pp.223-227 2008.8 Yamada,Y., Miyata,Y., Higashihara,M., Satou,K. Estimation of Identification Methods of Gene Clusters Using GO Term Annotations from a Hierarchical Cluster Tree Proc. of the 9th WSEAS International Conference on MATHEMATICS & COMPUTERS IN BIOLOGY & CHEMISTRY (MCBC '08), pp.194-198 2008.6 Higashihara,M., Rebolledo-Mendez,J.D., Yamada,Y., Satou,K. Ranking and Selection of Features for Improved Prediction of Nucleosome Occupancy and Modification Proc. of the 9th WSEAS International Conference on MATHEMATICS & COMPUTERS IN BIOLOGY & CHEMISTRY (MCBC '08), pp.188-193 2008.6 Tran,D.H., Pham,T.H., Satou,K., Ho,T.B. Prediction of microRNA Hairpins Using One-class Support Vector Machines Proc. of the 2nd International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (ICBBE 2008), pp.33-36 2008.5 Pham,T.H., Tran,D.H., Ho,T.B., Satou,K. Prediction of Histone Modifications in DNA sequences Proc. of the 7th IEEE International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE 2007), pp.959-966 2007.10 Casasnovas,J., Clemente,J.C., Miro-Julia,J., Rossello,F., Satou,K., Valiente,G. Fuzzy clustering improves phylogenetic relationships reconstruction from metabolic pathways (IPMU 2006, Paris, France) Proc. of the 11th International Conference on Information Processing and Management of Uncertainty in Knowledge-Based Systems (IPMU 2006), pp.2807-2814 2006.7 Tran,D.H., Pham,T.H., Satou,K., Ho,T.B. Conditional random fields for predicting and analyzing histone occupancy, acetylation and methylation areas in DNA sequences (EvoBio 2006, Budapest, Hungary) Proc. of EvoBio 2006, pp.221-230 2006.4 Clemente,J.C., Torisawa,K., Satou,K. Comparison of phrase indexing for biomedical and newswire documents (IFSR2005, Kobe, Japan) Proc. of the First International Congress of the International Federation for Systems Research (IFSR2005), S5-4-2 (6 pages in CD proceedings) 2005.11 Li,H., Yokota,K., Satou,K. Contractive conformational change of calmodulin caused by the central linker: A molecular dynamics simulation study (METMBS'05, Las Vegas, USA) Proc. of the 2005 International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and Biological Sciences (METMBS'05), pp.225-230 2005.6 Pham,T.H., Clemente,J.C., Satou,K., Ho,T.B. Rule evaluation heuristics for knowledge discovery (KDDMBS, Hanoi, Vietnam) Proc. of the Workshop on Knowledge Discovery and Data Management in Biomedical Science (KDDMBS) in conjunction with PAKDD-05, pp.29-44 2005.5 Yoshikawa,S., Satou,K., Konagaya,A. Drug interaction ontology (DIO) for inferences of possible drug-drug interactions (Medinfo 2004, San Francisco, USA) Proc. of Medinfo 2004, pp.454-458 2004.9 Clemente,J.C., Satou,K., Torisawa,K. Improving the identification of non-anaphoric it using support vector machines (NLPBA/BioNLP 2004, Geneva, Switzerland) Proc. of the International Workshop on Natural Language Processing in Biomedicine and its Applications (NLPBA/BioNLP 2004), pp.58-61 2004.8 Kamegai,S., Satou,K., Konagaya,A. Automated template discovery for information extraction from biomedical literature (CITSA 2004, Florida, USA) Proc. of the International Conference on Cybernetics and Information Technologies, Systems and Applications (CITSA 2004), Vol II, pp.39-44 2004.7 Tatsumoto,S., Satou,K., Konagaya,A. Prediction of protein secondary structure from PDB structure information based on sequence fragments Homology searching (METMBS'04, Las Vegas, USA) Proc. of the 2004 International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and Biological Sciences (METMBS'04), pp.250-255 2004.6 Clemente,J.C., Defago,X., Satou,K. Asynchronous peer-to-peer communication for failure resilient distributed genetic algorithms (PDCS2003, California, USA) Proc. of the 15th IASTED Intl. Conf. on Parallel and Distributed Computing and Systems (PDCS2003), Vol.II, pp.769-773 2003.11 Li,H., Yokota,K., Satou,K. Conformational change of calmodulin: A molecular dynamics simulation study (SCI2003, Florida, USA) Proc. of the 7th World Multiconference on Systemics, Cybernetics and Informatics (SCI2003), Vol. VIII, pp.47-52 2003.7 Minakuchi,Y., Satou,K., Konagaya,A. Prediction of protein-protein interaction sites using support vector machines (METMBS'03, Las Vegas, USA) Proc. of the 2003 International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and Biological Sciences (METMBS'03), pp.22-28 2003.6 Tatsumoto,S., Satou,K., Konagaya,A.,Kurita,J., Shimahara,H., Tate,S. Development of support tool for NMR spectrum analysis (METMBS'03, Las Vegas, USA) Proc. of the 2003 International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and Biological Sciences (METMBS'03), pp.159-164 2003.6 Satou,K., Ono,T., Yamamura,Y., Furuichi,E., Kuhara,S., Takagi,T. Extraction of substructures of proteins essential to their biological functions by a data mining technique (ISMB'97, Halkidiki, Greece) Proc. of the Fifth International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB'97), pp.254-257 1997.6 Satou,K., Takagi,T., Kanehisa,M. GenomeNet: overview and recent enhancements (8th AAAP animal science Congress, Chiba, Japan) Proc. of the Eighth Asian- Australasian Association of Animal Production Societies (AAAP) Animal Science Congress, Vol.I, pp.541-544 1996.1 Nishikawa,A., Satou,K., Furuichi,E., Kuhara,S., Ushijima,K. Equipments for statistical analysis in a deductive database system -their implementation and their application to protein structural analysis- (ADTI'94, Nara, Japan) Proc. of International Symposium on Advanced Database Technologies and Their Integration (ADTI'94), pp.237-244 1994.1 Satou,K., Furuichi,E., Takagi,T., Kuhara,S. Application of a deductive database system PACADE toward discovery of clusters of similar structures in proteins (HICSS27, Hawaii, USA) Proc. of the Twenty-Seventh Annual Hawaii International Conference on System Sciences (HICSS27), Vol.V, pp.160-169 1994.1 Satou,K., Furuichi,E., Takagi,T., Kuhara,S., Ushijima,K. Similar structure search in a deductive database (NDA'93, Fukuoka, Japan) Proc. of International Symposium on Next Generation Database Systems and Their Applications (NDA'93), pp.130-137 1993.9 Kuhara,S., Satou,K., Furuichi,E., Takagi,T., Takehara,H., Sakaki,Y. A deductive database system PACADE for the three dimensional structure of protein (HICSS24, Hawaii, USA) Proc. of the Twenty-Fourth Annual Hawaii International Conference on System Sciences (HICSS24), Vol.I, pp.653-659 1991.1