論文・発表等

卒論

2017年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  合場雅志	カテゴリカルな特徴と数量的特徴を用いた配列分類の精度向上
  川口翔太郎	スパースモデリングを用いた遺伝子変異データの特徴選択
  堀口玲央	テキストマイニングを用いた金沢大学研究者の特徴解析
  浅野剛史	動物の行動認識のための背景除去とボディパーツ認識
  窪田亨	サポートベクトルマシンを用いたナンバープレート検出
  門前智朗	撮影された物体に対する統計的形状モデルの半自動構築手法の開発

【2016年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  古市佑哉	可視画像と近赤外画像を結合した注射補助システムの改良
  竹村直太	実寸動画におけるオブジェクトトラッキング機能の実現
  田村正幸	画像の2次曲率を利用した血管内皮細胞画像に対する細胞検出ソフトウェアの開発
  梶谷成也	機械学習を用いたクロストリジウム株の変異解析
  嶋口芳希	薬剤の活性予測に適したディープラーニングのパラメータ探索

【2015年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  長谷篤志	次世代シーケンサを用いたMRSA株の変異解析
  森元史翔	気象観測データの収集・配信システムの構築
  濱田浩光	実寸写真表示のための仮想大画面の実現
  橋本祐	深度情報を用いた実寸動画の実現
  石本佑	可視画像と近赤外画像を統合した注射補助システムの実現
  齊藤雄太	4Dライブセルイメージデータ内のディスタンスマップを用いた細胞核検出

【2014年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  山本直樹	Denoising Autoencoderを用いた配列データからの深層学習
  鈴木悠太	Restricted Boltzmann Machineを用いた配列データからの深層学習
  山田琢己	そらなっとうの納豆菌に関する変異解析
  大井亜祐美	safe-SMOTEにおける安全領域の形状と大きさに関する研究
  的場一将	実寸写真の共有に関する研究2013年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  水上直紀	機械学習を用いたアミノ酸配列からのレクチンの予測
  島田賢人	RNA-seqデータからの新規リードスルー遺伝子の発見
  牛尾凜太郎	全クラスのオーバーサンプリングによる分類精度向上
  冨田直希	Exif情報の埋め込みによる交換可能な実寸写真の実現
  渡部起平	補助基準物を用いた実寸写真の精度向上

【2012年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  松山哲生	Snakeを用いた肺腫瘤の輪郭抽出に関する研究
  川口翔太郎	基準物を用いた画像内オブジェクトの計測に関する研究
  武田徳明	構文情報を用いた名詞の意味推定に関する研究
  栗山久範	k-mer頻度による配列の特徴付けと次元圧縮の効果に関する研究
  架谷祐希	距離に基づく近傍法に関する研究

【2011年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  門端卓朗	生物種推定における不整合性の検出と精度改善に関する研究
  谷直征	相関行列に基づいたがんマイクロアレイデータセットの比較解析
  関谷修吾	タイムコースデータからの遺伝子発現量予測の精度向上に関する研究
  島津純哉	多変量解析による多機能遺伝子の推定
  澤田紘樹	遺伝子発現データ特異的GO termの新規同定法の有用性検討

【2010年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  中野賢司	検索エンジンのn-gram統計データを用いた単語の意味分類に関する研究
  中山剣太	配列断片の構造エントロピーを用いたタンパク質立体構造分類に関する研究
  酒井英行	相関行列に基づいたマイクロアレイデータセットの比較に関する研究
  宮原大貴	細胞種間におけるDNAメチル化の比較
  河野曜介	DNAメチル化のデータベース作成

【2009年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  吉田正和	評価分析手法を用いた薬剤の効果分析に関する研究
  前田康孝	複数の形容詞と名詞の修飾関係に基づく単語の意味分類に関する研究
  辰巳和也	ファジィクラスタリングを用いた単語の多義性の解析に関する研究
  寺田圭祐	述語項構造に基づく動詞の意味分類に関する研究
  神谷道夫	遺伝子制御ネットワークに影響を及ぼすDNAメチル化の同定

【2008年3月 卒業論文(動画は学内限定)】
  明姓愛香	形容詞-名詞の修飾関係に基づく単語の意味分類に関する研究
  太田和徳	計算機シミュレーションによる蛋白質間相互作用の予測

修論

2017年3月 修士論文(動画は学内限定)】
  齊藤雄太	線虫の神経細胞配置データを利用した神経細胞名特定のための人工知能技術の開発
  長谷篤志	ホウキタケ属のゲノム配列解析
  濱田浩光	深度センサ付きカメラを用いた動物体表面のトラッキング
  森元史翔	二次元降雪粒子データの凹凸形状解析

【2016年3月 修士論文(動画は学内限定)】
  Nguyen, Ngoc Giang	DNA Sequence Classification by a Deep Learning Algorithm for Text Classification
  山本直樹	テキストマイニングを用いた薬剤と病気の関係抽出
  鈴木悠太	細胞移動経路の最適化に基づく4D画像データ中の細胞領域自動追跡手法の開発

【2015年3月 修士論文(動画は学内限定)】
  島田賢人	遺伝子発現データ視覚化のための次元削減手法統合ソフトウェアの開発

【2014年3月 修士論文(動画は学内限定)】
  川口翔太郎	ライブセル4Dイメージ内の多数の細胞領域を対象としたマルコフ確率場に基づく追跡手法の開発
  武田徳明	テキストマイニングを用いた抗がん剤関連の知識抽出

【2013年3月 修士論文(動画は学内限定)】
  谷直征	状態空間モデルを用いた超高次元逐次データに対するクラスタリング手法の開発
  門端卓朗	メタゲノムアセンブラMetaVelvetの有効性の検証

【2012年3月 修士論文(動画は学内限定)】
  張鵬	Classification of Kinase Group in Protein Phosphorylation based on 3D Structure of Substrates(
タンパク質リン酸化修飾における基質構造情報に基づくキナーゼ分類に関する研究)
  Tran Vu Anh	D-IMPACT: A Data Preprocessing Method to Optimize the Intracluster and Intercluster Similarity for Clustering(クラスタリングのためのクラス内およびクラス間類似度を最適化するデータ処理手法D-IMPACTに関する研究)
  中山剣太	局所的なクラスインバランスに着目したオーバーサンプリング手法に関する研究

【2011年3月 修士論文(動画は学内限定)】
  吉田正和	ヒストンのメチル化制御酵素が標的とする遺伝子の探索とがんの抑制との関連に関する研究
  前田康孝	構文情報を用いたセンテンス間の意味的類似性の計算方法に関する研究
  辰巳和也	クラスタリングを用いた局所適応型オーバーサンプリングとその効果に関する研究
  神谷道夫	細胞種間遺伝子ネットワーク差異に寄与するエピゲノムの同定

【2010年3月 修士論文(動画は学内限定)】
  明姓愛香	生物医学用語の意味推定に関する研究
  嶋田孝徳	遺伝子発現データの階層的分類
  瀬戸司	エピトープ領域の抗原性に対する分子動力学的アプローチ
  太田和徳	蛋白質間結合に影響を及ぼす遺伝子多型の探索
  守優輔	行動解析による魚類網膜ドパミン細胞の機能解析

研究会・全国大会・国際会議ポスター等

嶋口芳希, 久保守, 佐藤賢二
薬剤の活性予測に適したディープラーニングのパラメータ探索
平成28年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2. パターン認識・理解2
F2-43
2016年9月13-14日

長谷篤志, 久保守, 岩田恭宜, 和田隆志, 佐藤賢二
MRSA株の変異情報に基づく発症予測と薬剤耐性予測
平成27年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2. その他1
F2-5
2015年9月12-13日

森元史翔, 久保 守, 佐藤 賢二
気象観測データのサーバ構築
平成27年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2. その他1
F2-6
2015年9月12-13日

山本 直樹, 武田 徳明, 佐藤 賢二
テキストマイニングを用いた抗がん剤類似物質の探索
平成26年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2. その他3
F81
2014年9月11-12日

鈴木 悠太, 佐藤 賢二
Restricted Boltzmann Machineを用いた配列データからの深層学習
平成26年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2. その他3
F75
2014年9月11-12日

島田賢人, 佐藤賢二, 広瀬修
RNA-seqデータからの新規リードスルー発見
平成25年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2. 情報処理2
F2-43
2013年9月21-22日

Saethang,T., Hirose,O., Kimkong,I., Satou,K.
ANALYSIS OF ANTIBACTERIAL AND TUMOR HOMING PEPTIDES USING SUPPORT VECTOR MACHINE
The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013)
p.64
3-10 January 2013

Dang,X.T., Hirose,O., Satou,K.
IMPROVING CLASSIFICATION PERFORMANCE OF REAL AND PSEUDO MIRNA PRECURSORS
The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013)
p.117
3-10 January 2013

Tran,V.A., Hirose,O., Satou,K.
D-IMPACT: AN EFFECTIVE METHOD TO IMPROVE THE CLUSTERING PERFORMANCE ON GENE EXPRESSION DATA
The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013)
p.123
3-10 January 2013

Nguyen,L.A.T., Hirose,O., Satou,K.
APPLICATION OF AN UNDER-SAMPLING METHOD TO BETATURN PREDICTION
The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013)
p.121
3-10 January 2013

Le,T.K.T., Hirose,O., Satou,K.
AN APPROACH TO EXTEND DOMAIN-DOMAIN INTERACTION NETWORKS BASED ON PROTEIN DOMAIN FUNCTIONAL SIMILARITY
The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013)
p.120
3-10 January 2013

Satou, K. 
ANALYSIS OF NOUN PHRASES EXTRACTED FROM BIOMEDICAL TEXTS FOR SEMANTIC CATEGORY PREDICTION
The Pacific Symposium on Biocomputing 2013 (PSB2013)
p.122
3-10 January 2013

Satou, K., Zhang, P., Kawaguchi, S.
Classification of Kinase Group in Protein Phosphorylation
Joint Conference on Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology
B62_136
14-17 October 2012

佐藤賢二
スマートフォン等を用いた実寸写真の生成とサイズ測定
イノベーション・ジャパン2012
I-16
2012年9月27-28日

武田徳明, 佐藤賢二
構文情報を用いた名詞の意味推定
平成24年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2.情報処理・その他
F-118
2012年9月1-2日

タンパク質リン酸化部位に作用するキナーゼの予測
川口翔太郎, 張鵬, 佐藤賢二
平成24年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2.情報処理・その他
F-119
2012年9月1-2日

Dang,X.T., Satou,K.
A Novel Over-Sampling Method and its Application to Cancer Classification from Gene Expression Data
The 2011 Joint Conference of CBI and JSBi
CBI-P3-4
8-10 November 2011

Saethang,T., Kimkong,I., Satou,K.
Quantitative HLA-Peptide Binding Prediction Using Amino Acid Pairwise Contact Potentials and HLA-Peptide Contact Site Information
The 2011 Joint Conference of CBI and JSBi
CBI-P3-5
8-10 November 2011

Tran,V.A., Satou,K.
Predicting the Clam Yield in Ben Tre from Environmental Data
The 2011 Joint Conference of CBI and JSBi
CBI-P3-6
8-10 November 2011

谷直征, 関谷修吾, 佐藤賢二
サポートベクターマシンを用いた遺伝子発現量予測
平成23年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2. ヒューマンインタフェース2
F-110
2011年9月17-18日

門端卓朗, 佐藤賢二
生物種推定における不整合性の検出と精度改善に関する研究
平成23年度電気関係学会北陸支部連合大会
F2. ヒューマンインタフェース2
F-111
2011年9月17-18日

Tran,V.A., Satou,K.
APPLICATION OF ATTRACTION BASED CLUSTERING ALGORITHM TO CANCER GENE DATASETS
The Ninth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2011)
APBC2011 Conference
P262
11-14 January 2011

Zhan,P., Satou,K.
PERFORMANCE EVALUATION OF SUPPORT VECTOR MACHINES FOR POST-TRANSLATIONAL MODIFICATION
The Ninth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2011)
APBC2011 Conference
P278
11-14 January 2011

Satou,K.
SEMANTIC CLUSTERING OF BIOMEDICAL WORDS USING GOOGLE WEB 1T 5-GRAM
The Ninth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2011)
APBC2011 Conference
P285
11-14 January 2011

宮原大貴 佐藤賢二 山田洋一
ヒトのCpG islandにおけるDNAメチル化状態の検討
平成22年度電気関係学会北陸支部連合大会
B部門 回路・医用電子
B-12
2010年9月11-12日

中山剣太 辰巳和也 山田洋一 佐藤賢二
rRNA配列を用いた真核生物の生物種推定におけるSMOTEの効果について
平成22年度電気関係学会北陸支部連合大会
F部門 情報処理 情報処理3
F-54
2010年9月11-12日

Kamiya,M., Satou,K., Yamada,Y.
Identification of DNA Methylation Which Leads to Differences of Gene Interaction Network between Cell Types
The 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009)
Genome Informatics 2009 (Poster and Software Demonstrations)
P037-1,P037-2
14-16 December 2009

Myosho,A., Nakano,K., Yamada,Y., Satou,K.
Semantic Classification of Nouns in UMLS Using Google Web 1T 5-gram
The 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009)
Genome Informatics 2009 (Poster and Software Demonstrations)
P102-1,P102-2
14-16 December 2009

嶋田孝徳, 山田洋一, 佐藤賢二
遺伝子発現データの階層的分類に関する研究
平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会
F部門 情報処理 情報処理2
F-64
2009年9月12-13日

辰巳和也, 山田洋一, 佐藤賢二
配列からの酵素機能推定手法の改善について
平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会
F部門 情報処理 情報処理2
F-65
2009年9月12-13日

吉田正和, 山田洋一, 佐藤賢二
rRNA配列を用いた真核生物の生物種推定手法
平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会
F部門 情報処理 情報処理2
F-66
2009年9月12-13日

瀬戸司, 山田洋一, 佐藤賢二
エピトープ領域の部分配列の抗原性と立体構造の関係について
平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会
F部門 情報処理 情報処理2
F-67
2009年9月12-13日

中野賢司, 山田洋一, 佐藤賢二
検索エンジンのn-gram統計データを用いた単語の意味分類
平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会
F部門 情報処理 パターン認識・理解3
F-47
2009年9月12-13日

前田康隆, 山田洋一, 佐藤賢二
複数の形容詞と名詞の修飾関係に基づく単語の意味分類に関する研究
平成21年度電気関係学会北陸支部連合大会
F部門 情報処理 知識処理/ニューラルネットワーク
F-49
2009年9月12-13日

明姓愛香, 山田洋一, 佐藤賢二
単語の意味分類における潜在意味解析の効果について
平成20年度電気関係学会北陸支部連合大会
F部門 情報処理関係 知識処理
F-42
2008年9月12-13日

太田和徳, 山田洋一, 佐藤賢二
蛋白質機能に影響を及ぼす遺伝子多型の探索
平成20年度電気関係学会北陸支部連合大会
B部門 回路・医用電子関係 回路・医用電子3
B-13
2008年9月12-13日

Myosho,A., Miyata,Y., Yamada,Y., Satou,K.
Analysis of Adjective-Noun Co-occurrence In Biomedical Text
The Sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2008)
The Sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (Poster Abstract)
P91
14-17 January 2008

ジャーナル・国際会議


Phan,D., Nguyen,N.G., Lumbanraja,F.R., Faisal,M.R., Abapihi,B., Purnama,B., Delimayanti,M.K., Kubo,M., Satou,K.
Combined Use of k-Mer Numerical Features and Position-Specific Categorical Features in Fixed-Length DNA Sequence Classification
Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.10, No.8, pp.390-401
2017.8

Nguyen,N.G., Tran,V.A., Ngo,D.L., Phan,D., Lumbanraja,F.R., Faisal,M.R., Abapihi,B., Kubo,M., Satou,K. 
DNA Sequence Classification by Convolutional Neural Network
Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.9, No.5, pp.280-286
2016.4

Ngo,D.L., Yamamoto, N., Tran,V.A., Nguyen,N.G., Phan,D., Lumbanraja,F.R., Kubo,M., Satou,K.
Application of Word Embedding to Drug Repositioning
Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.9, No.1, pp.7-16
2016.1

Miyahara,H., Hirose,O., Satou,K., Yamada,Y.
Factors to preserve CpG-rich sequences in methylated CpG islands
BMC Genomics, 16:144
2015.2

Gavrilov,S., Kubo,M., Tran,V.A., Ngo,D.L, Nguyen,N.G., Nguyen,L.A.T., Lumbanraja,F.R., Phan,D., Saethang,T., Satou,K.
Feature Analysis and Classification of Particle Data from Two-Dimensional Video Disdrometer
Advances in Remote Sensing, Vol.4, No.1, pp.1-14
2015.1

Nguyen,L.A.T., Dang,X.T., Le,T.K.T., Saethang,T., Tran,V.A., Ngo,D.L, Gavrilov,S., Nguyen,N.G., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
Predicting Beta-Turns and Beta-Turn Types Using a Novel Over-Sampling Approach
Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.7, No.11, pp.927-940
2014.9

Li,J., Liu,J., Toivonen,H., Satou,K., Sun,Y., Sun,B.
Discovering Statistically Non-Redundant Subgroups
Knowledge-Based Systems, Vol.67, pp.315–327
2014.9

Le,T.K.T., Hirose,O., Nguyen,L.A.T., Saethang,T., Tran,V.A., Dang,X.T., Ngo,D.L, Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
Inference of domain-domain interactions by matrix factorisation and domain-level features
International Journal of Functional Informatics and Personalised Medicine, Vol.4, Issue 3-4, pp.259-273
2014

Tran,V.A., Hirose,O., Saethang,T., Nguyen,L.A.T., Dang,X.T., Le,T.K.T., Ngo,D.L, Gavrilov, S., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
D-IMPACT: A Data Preprocessing Algorithm to Improve the Performance of Clustering
Journal of Software Engineering and Applications, Vol.7, No.8, pp.639-654
2014.7

Le,T.K.T., Hirose,O., Tran,V.A., Saethang,T., Nguyen,L.A.T., Dang,X.T., Ngo,D.L, Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
Predicting residue contacts for protein-protein interactions by integration of multiple information
Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.7, No.1, pp.28-37
2014.1

Nguyen,L.A.T., Hirose,O., Dang,X.T., Le,T.K.T., Saethang,T., Tran,V.A., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
Improving the Prediction of Protein-Protein Interaction Sites Using a Novel Over-Sampling Approach and Predicted Shape Strings
Annual Review & Research in Biology, Vol.3, Issue 2, pp.92-106
2013.3

Le,T.D., Liu,L., Liu,B., Tsykin,A., Goodall,G.J., Satou,K., Li,J.
Inferring microRNA and transcription factor regulatory networks in heterogeneous data
BMC Bioinformatics 2013, 14:92
2013.3

Dang,X.T., Hirose,O., Saethang,T., Tran,V.A., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
A novel over-sampling method and its application to miRNA prediction
Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol.6, No.2A, pp.236-248
2013.2

Dang,X.T., Hirose,O., Bui,D.H., Saethang,T., Tran,V.A., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
A Novel Over-Sampling Method and its Application to Cancer Classification from Gene Expression Data
Chem-Bio Informatics Journal, Vol.13, pp.19-29
2013.1

Saethang,T., Hirose,O., Kimkong,I., Tran,V.A., Dang,X.T., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
PAAQD: Predicting immunogenicity of MHC class I binding peptides using amino acid pairwise contact potentials and quantum topological molecular similarity descriptors
Journal of Immunological Methods, Vol.387, Issues 1-2, pp.293-302
2013.1

Yamada,Y., Sawada,H., Hirotani,K., Oshima,M., Satou,K.
Validation of MIMGO: a method to identify differentially expressed GO terms in a microarray dataset
BMC Research Notes 2012, 5:680
2012.12

Saethang,T., Hirose,O., Kimkong,I., Tran,V.A., Dang,X.T., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
EpicCapo: epitope prediction using combined information of amino acid pairwise contact potentials and HLA-peptide contact site information
BMC Bioinformatics 2012, 13:313
2012.11

Tran,V.A., Clemente,J.C., Nguyen,D.T., Li,J., Dang,X.T., Le,T.K.T., Nguyen,L.A.T., Saethang,T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K.
IMPACT: A Novel Clustering Algorithm based on Attraction
Journal of Computers, Vol.7, No.3, pp.653-665
2012.3

Kong,D., Piao,Y.S., Yamashita,S., Oshima,H., Oguma,K., Fushida,S., Fujimura,T., Minamoto,T., Seno,H., Yamada,Y., Satou,K., Ushijima,T., Ishikawa,T., Oshima,M. 
Inflammation-induced repression of tumor suppressor miR-7 in gastric tumor cells 
Oncogene, Vol.31, Issue 35, pp.3949–3960
2011.12

Yoshida,M., Ishimura,A., Terashima,M., Enkhbaatar,Z., Nozaki,N., Satou,K., Suzuki,T.
PLU1 histone demethylase decreases the expression of KAT5 and enhances the invasive activity of the cells
Biochemical Journal, Vol.437, No.3, pp.555-564
2011.8

Tran,D.H., Ho,T.B., Pham,T.H., Satou,K.
MicroRNA expression profiles for classification and analysis of tumor samples
IEICE Transactions on Information and Systems, E94-D, No.3, pp.416-422
2011.3

Tran,D.H., Satou,K., Ho,T.B., Pham,T.H.
Computational Discovery of miR-TF Regulatory Modules in Human Genome
Bioinformation, Vol.4, No.8, pp.371-377
2010.2

Yamada,Y., Hirotani,K., Satou,K., Muramoto,K.
An identification method of data-specific GO terms from a microarray data set
IEICE Transactions on Information and Systems, E92-D, No.5, pp.1093-1102
2009.5

Tran,D.H., Pham,T.H., Satou,K., Ho,T.B.
Finding microRNA regulatory modules in human genome using rule induction
BMC Bioinformatics, Vol.9(Suppl.12):S5(10 pages)
2008.12

Tran,D.H., Pham,T.H., Satou,K., Ho,T.B.
Prediction of human microRNA hairpins using only positive sample learning
Journal of Biomedical Science and Engineering (JBiSE), Vol.1, Issue 2, pp.141-146
2008.8

Satou,K., Konno,K., Ohta,O., Mikami,K., Teranishi,K., Yamada,Y., Ohki,S.
Performance Evaluation of Parallel Processing Environment for Molecular Dynamics
WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 7, pp.173-182
2008.7

Rebolledo-Mendez,J.D., Higashihara,M., Yamada,Y., Satou,K.
Characterization and Clustering of GO Terms by Feature Importance Vectors Obtained from Microarray Data
WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 7, pp.163-172
2008.7

Yamada,Y., Satou,K.
Prediction of Genomic Methylation Status on CpG Islands Using DNA Sequence Features
WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 7, pp.153-162
2008.7

Higashihara,M., Rebolledo-Mendez,J.D., Yamada,Y., Satou,K.
Application of a Feature Selection Method to Nucleosome Data: Accuracy Improvement and Comparison with Other Methods
WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 5, pp.95-104
2008.5

Yamada,Y., Miyata,Y., Higashihara,M., Satou,K.
Comparison of Cluster Identification Methods for Selection of GO Terms related to Gene Clusters
WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine, Vol.5, Issue 3, pp.54-63
2008.3

Clemente,J.C., Satou,K., Valiente,G.
Phylogenetic reconstruction from non-genomic data
Bioinformatics, Vol.23, No.2, pp.110-115
2007.1

Clemente,J.C., Satou,K., Valiente,G.
Finding conserved and non-conserved reactions using a metabolic pathway alignment algorithm
Genome Informatics Series, Vol.17, No.1, pp.46-56
2006.12

Satou,K., Tsuji,S., Nakashima,Y.,Konagaya,A.
Parallel and pipelined database transfer in a grid environment for bioinformatics
Grid Computing in Life Science, Vol.2, pp.255-262
2006.10

Yokota,K., Satou,K., Ohki,S.
Comparative analysis of protein thermostability: difference in contents and substitutions of amino acid types on the surface and in the core regions of thermophilic and mesophilic proteins
Science and Technology of Advanced Materials, Vol.7, pp.255-262
2006.6

Pham,T.H., Tran,D.H., Ho,T.B., Satou,K., Valiente,G.
Qualitatively predicting acetylation and methylation areas in DNA sequences
Genome Informatics Series, Vol.16, No.2, pp.3-11
2005.12

Clemente,J.C., Satou,K., Valiente,G.
Reconstruction of Phylogenetic relationships from metabolic pathways based on the enzyme hierarchy and the gene ontology
Genome Informatics Series, Vol.16, No.2, pp.45-55
2005.12

Pham,T.H., Clemente,J.C., Satou,K., Ho,T.B.
Computational discovery of transcriptional regulatory rules
Bioinformatics, Vol.21, Suppl.2, pp.101-107
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